Nous sommes sur Zaïkaro, une île totalement à l'écart du monde, cachée sur l'équateur. Cette île est peuplée de Pokemon et de plantes rares. Il y fait un climat exotique chaud et humide. Cependant, un jour, Leuphorie, l'actuel chef de guilde à cette époque, partit en exploration dans la jungle. Il y trouva des ruines étranges. Les textes sur les murs ressemblaient fort au language Zarbi, mais ce n'en était pas, le D-Koder 3000, technologie fiable à 98%, le certifiait et n'était pas programmé pour ce genre de symboles. Quelques jours plus tard, les membres de la guilde remarquèrent que leur chef n'était pas rentré. Ils partirent donc voir et trouvèrent le cadavre de Leuphorie, loin des ruines, et naturellement en décomposition. Son corps était coupé en deux et se yeux arrachés traînaient par terre. Un poignard était enfoncé dans le sol près de ce qu'il restait de son oreille. Bien entendu, cette nouvelle effrayante fit le tour du continent en un éclair, et plus personne ne sortit de chez lui à partir d'ici. Le meurtrier en cavale, le meilleur enquêteur de l'île, un Zorroark, décida de prendre son courage à deux mains et partit enquêter dans les ruines. Il fit alors une découverte : A l'intérieur de la bâtisse, au millieu de la salle, se trouvaient 7 piédestraux, en cercle. Tous portaient des marques identiques à celles sur les murs. Tous contenaient un cristal vert. Tous, sauf un. Le Loup-garou se souvint alors de la position de la main droite de Leuphorie : elle était fermée comme si elle tenait un objet, mais elle était vide. Deux jours après, les quelques habitants qui étaient sortis, vu qu'aucun meurtre supplémentaire ne s'était passé jusqu'à maintenant, retournèrent en courant se barricader chez eux. Pendu à la majestueuse statue de Zekrom placée au centre de Bourg-de-l'Aube, par les pieds, se trouvaient le cadavre de Zorroark, un cristal bleu en main, mais aussi celui de l'un des habitants, un Machoc, un enfant, les joues perforées de trois balles de chaque côté. Les semaines passèrent, et les cadavres s'entassèrent. Le village devînt encore plus vide qu'auparavant. La guilde finit par s'en réduire à... Trois membres, un Lixy, un Airmure et un Noctunoir, les autres êtants morts. Un portail multi-dimensionnel s'ouvrit alors sur la plage... Vous seuls, sortis de ce portail, transformé en Pokemon, par la force de votre aura pur, pourrez sauver l'île de Zaïkaro.